• Estudio de los procesos de latencia y reactivación del VIH-1: principales mecanismos homeostáticos responsables de la latencia proviral y la generación de los reservorios virales que imposibilitan la erradicación de la enfermedad.
• Análisis de los mecanismos de transactivación responsables de la replicación viral activa en linfocitos T CD4+: mecanismos virales implicados en reactivación del provirus.
• Estudio de mecanismos que impidan la infección y replicación viral eficaz en células del reservorio viral secundario como son los monocitos/macrófagos.
• Estudio de los mecanismos moleculares subyacentes y diseño de nuevas estrategias terapéuticas contra COVID persistente.
• Análisis de biomarcadores predictivos de gravedad en pacientes con distintas presentaciones de COVID-19.
• Definición de biomarcadores predictivos de recaída en pacientes con leucemia mieloide crónica que hayan interrumpido el tratamiento con inhibidores de tirosina kinasas.
• Estudio de reconstitución inmune en personas con trasplante de médula ósea y órgano sólido.
• Análisis de la eficacia de las vacunas preventivas en personas con cáncer hematológico.
• Análisis de biomarcadores predictivos de incidencia de cáncer colorrectal en personas menores de 50 años.

• Evaluation of the safety and efficacy of dasatinib to reduce HIV-1 reservoir, inflammation and senescence in people with HIV on long-term antiretroviral treatment. IP: Mayte Coiras. Agencia financiadora: Proyectos de Investigación Clínica Independiente, Acción Estratégica en Salud Intramural (AESI). Duración: 2025 –2028. Expediente contrato/proyecto: ICI24CIII/00003.
• Dasatinib for HIV-1 reservoir reduction. IP: Mayte Coiras. Agencia financiadora: American Foundation for AIDS Research (AmFAR). Duración: 2024 –2026. Expediente contrato/proyecto: 14013.
• Infección en receptores de Trasplante de Órgano Sólido: correlación con la función inmunitaria. Identificación de Biomarcadores predictivos y evaluación de factibilidad con terapia celular CD45RAneg. IPs: Alejandro Luna de Abia, Jesús Fortún. Colaboradora: Mayte Coiras. Agencia financiadoras: Acción Estratégica en Salud (AES) 2023. Duración: 2024-2026. Expediente contrato/proyecto: PI23/01924.
• Estudio del efecto de la inmunoterapia y el tratamiento antirretroviral a largo plazo sobre la evolución del reservorio del VIH durante la infección crónica: Búsqueda de nuevas estrategias para una cura funcional. IP: Mayte Coiras. Organismo financiador: Ministerio de Ciencia e Innovación. Plan Estatal de Investigación Científica, Técnica y de Innovación 2021-2023. Duración: 2023-2027. Nº Expediente PID2022-141317OB-I00.
• Estudio longitudinal de la evolución de parámetros inmunológicos en personas con COVID persistente: definición de biomarcadores de persistencia. IP: Mayte Coiras. Organismo financiador: Acción Estratégica en Salud Intramural. Duración: 2023-2025. Nº de Expediente PI22CIII/00059.
• Evaluación de los niveles del Sistema asociado a BLyS en pacientes con síndromes post-infecciosos y alteraciones disautonómicas del ritmo cardiaco. IP: Pablo Guisado (Mayte Coiras, colaboradora). Organismo financiador: Sociedad Española de Medicina Interna SEMI. Duración: 2023-2025.
• Prospective, observational, longitudinal, multicenter study to evaluate clinical efficacy, safety and immunogenicity developed in individuals with Philadelphia-negative Chronic Myeloproliferative Neoplasms treated with JAK inhibitors after receiving full vaccination with Adjuvanted Herpes Zoster Subunit vaccine (Shingrix). IPs: Valentín García Gutiérrez. Organismo financiador: GSK Glaxo Smithkline. Duración: 2024-2025.

Martinez-Laso J, Cervera I, Martinez-Carrasco MS, Briz V, Crespo-Bermejo C, Sánchez-Menéndez C, Casado-Fernández G, Torres M, Coiras M. Characterisation of LGP2 complex multitranscript system in humans: role in the innate immune response and evolution from non-human primates. Hum Mol Genet. 2025 Jan 23;34(1):11-20. doi: 10.1093/hmg/ddae155. PMID: 39505366.

Manzanares M, Ramos-Martín F, Rodríguez-Mora S, Casado-Fernández G, Sánchez-Menéndez C, Simón-Rueda A, Mateos E, Cervero M, Spivak AM, Planelles V, Torres M, García-Gutiérrez V, Coiras M. Sustained antiviral response against in vitro HIV-1 infection in peripheral blood mononuclear cells from people with chronic myeloid leukemia treated with ponatinib. Front Pharmacol. 2024 Sep 23;15:1426974. doi: 10.3389/fphar.2024.1426974. PMID: 39380908; PMCID: PMC11460598.

Sánchez-Menéndez C, de la Calle-Jiménez O, Mateos E, Vigón L, Fuertes D, Murciano Antón MA, San José E, García-Gutiérrez V, Cervero M, Torres M, Coiras M. Different polarization and functionality of CD4+ T helper subsets in people with post-COVID condition. Front Immunol. 2024 Aug 27;15:1431411. doi: 10.3389/fimmu.2024.1431411. PMID: 39257580; PMCID: PMC11385313.

Rodríguez-Mora S, Sánchez-Menéndez C, Bautista-Carrascosa G, Mateos E, Moreno-Serna L, Megías D, Cantón J, García-Gutiérrez V, Murciano-Antón MA, Cervero M, Spivak A, Planelles V, Coiras M. Dasatinib interferes with HIV-1 proviral integration and the inflammatory potential of monocyte-derived macrophages from people with HIV. Biochem Pharmacol. 2024 Nov;229:116512. doi: 10.1016/j.bcp.2024.116512. Epub 2024 Sep 1. PMID: 39222713.

Casado-Fernández G, Cantón J, Nasarre L, Ramos-Martín F, Manzanares M, Sánchez-Menéndez C, Fuertes D, Mateos E, Murciano-Antón MA, Pérez-Olmeda M, Cervero M, Torres M, Rodríguez-Rosado R, Coiras M. Pre-existing cell populations with cytotoxic activity against SARS-CoV-2 in people with HIV and normal CD4/CD8 ratio previously unexposed to the virus. Front Immunol. 2024 May 15;15:1362621. doi: 10.3389/fimmu.2024.1362621. PMID: 38812512; PMCID: PMC11133563.

Rodríguez-Mora S, Corona M, Solera Sainero M, Mateos E, Torres M, Sánchez-Menéndez C, Casado-Fernández G, García-Pérez J, Pérez-Olmeda M, Murciano-Antón MA, López-Jiménez J, Coiras M (AC), García-Gutiérrez V. Regular Humoral and Cellular Immune Responses in Individuals with Chronic Myeloid Leukemia Who Received a Full Vaccination Schedule against COVID-19. Cancers (Basel). 2023 Oct 20;15(20):5066. doi: 10.3390/cancers15205066.

Rodríguez-Mora S, Pérez-Lamas L, Solera Sainero M, Torres M, Sánchez-Menéndez C, Corona M, Mateos E, Casado-Fernández G, Alcamí J, García-Pérez J, Pérez-Olmeda M, Murciano-Antón A, López-Jiménez J, García-Gutiérrez V, Coiras M (AC). Persistent Immunity against SARS-CoV-2 in Individuals with Oncohematological Diseases Who Underwent Autologous or Allogeneic Stem Cell Transplantation after Vaccination. Cancers 2023, 15(8), 2344. doi.org/10.3390/cancers15082344. https://www.mdpi.com/2072-6694/15/8/2344

Casado-Fernández G, Corona M, Torres M, Saez AJ, Ramos-Martín F, Manzanares M, Vigón L, Mateos E, Pozo F, Casas I, García-Gutierrez V, Rodríguez-Mora S, Coiras M (AC). Sustained Cytotoxic Response of Peripheral Blood Mononuclear Cells from Unvaccinated Individuals Admitted to the ICU Due to Critical COVID-19 Is Essential to Avoid a Fatal Outcome. Int J Environ Res Public Health. 2023 Jan20;20(3):1947. doi: 10.3390/ijerph20031947. PMID: 36767310. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36767310/

Williams ES, Martins TB, Shah KS, Hill HR, Coiras M, Spivak AM, Planelles V. Cytokine Deficiencies in Patients with Long-COVID. J Clin Cell Immunol. 2022;13(6):672. PMID: 36742994. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36742994/

Williams ESCP, Szaniawski MA, Martins LJ, Innis EA, Alcamí J, Hanley TM, Spivak AM, Coiras M, Planelles V. Dasatinib: effects on the macrophage phospho proteome with a focus on SAMHD1 and HIV-1 infection. Clin Res HIV AIDS.2022;8(1):1053. PMID: 36589263; PMCID: PMC9802671. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36589263/

• Cultivos celulares y virales.
• Extracción de proteínas y ácidos nucleicos.
• Técnicas de transfección de células de mamífero.
• Técnicas de citometría de flujo, marcajes en superficie e intracitoplasmáticos, análisis de subpoblaciones.
• Ensayos de western blot e inmunoprecipitación.
• Ensayos de transcriptómica y proteómica.
• Amplicación génica mediante PCR convencional, qPCR y dPCR.
• Genotipado mediante qPCR.
• Cribado y caracterización de la actividad antiviral de nuevos compuestos.
• Análisis de citoquinas mediante Luminex.
• Ensayos de citotoxicidad celular y mediada por anticuerpos.
• Análisis de factores de transcripción, ensayos de inmunoprecipitación de cromatina.
• Cuantificación del reservorio viral en sangre y tejidos.

Algunas infraestructuras son de uso común por los laboratorios del centro:

• Gene Amp PCR Thermal Cycler System 2700 (Applied Biosystems).
• StepOne Plus Thermal Cycler (Applied Biosystems).
• Microscopio confocal Leica TCS SP5.
• Microscopio de fluorescencia con cámara de incubación Leica DM4000B.
• Microscopio óptico invertido Leica DM IL LED.
• Chemidoc Imaging System (BioRad).
• Luminómetro Sirius (Berthold Detection Systems).
• Luminómetro de placa (Berthold Detection Systems), Simplicity software (Berthold tection Systems).
• Secuenciador automático ABI Prism 377 (Applied Biosystems).
• Automatic analyzer Elecsys 2010 (Roche).
• Cabinas de flujo laminar e incubadores de CO2.
• Contador de células automático TC20 (BioRad).
• BD LSRFortessa™ X20 flow cytometer, con FACSDiva y FlowJo softwares.
• Nanodrop 2000C (Thermo Scientific).
• BioRad C1000 thermal cycler (BioRad).
• Luminex 200 system software (R&D systems).
• QuantStudio 3D Digital PCR System (Thermo Fisher).
• QuantStudio 5 PCR System (Thermo Fisher).
• QX200 Droplet Digital PCR System