• Emilia Mellado Terrado. Aspergillus fumigatus, Mecanismos de Resistencia a los antifúngicos.
• Óscar Zaragoza Hernández. Mecanismos de adaptación de hongos patógenos al huésped y desarrollo de nuevas terapias antifúngicas.
• María José Buitrago Serna. Desarrollo de nuevos métodos de diagnóstico de infección fúngica invasora.
• Alicia Gómez López. Estudio de la relación exposición y respuesta en el tratamiento con antifúngicos.
• Ana Alastruey-Izquierdo. Epidemiología de las infecciones fúngicas, estudios de sensibilidad, nuevos antifúngicos y aspergilosis pulmonar crónica.
• Laura Alcázar Fuoli. Estudio de la susceptibilidad del huésped a las infecciones fúngicas invasoras.

• Consorcio Centro de Investigacion Biomedica en Red (CIBER). Área de Enfermedades Infecciosas. IP: Emilia Mellado Terrado Organismo financiador: CIF: G85296226.  Financiación: 85.000 € (primer año. Duración: 2022-2026.Expediente CB21/13/00105.
• Buscando los rasgos genéticos de la resistencia de Aspergillus fumigatus a los azoles para preservar la eficacia de los azoles: un enfoque de salud global. IP: Emilia Mellado Terrado. Organismo financiador: Fondo de Investigación Sanitaria. Financiación: 47.000 €. Duración: 2022-2024. Nº de Expediente: PI21CIII/00028_ MPY443/2021.
• Mecanismos de adaptación de la levadura patógena Cryptococcus neoformans al pulmón y nuevas terapias. Agencia Estatal de Investigación. IP: Óscar Zaragoza. Dotación: 117.000 €. Duración: 2022-2024. Nº de Expediente: PID2020-114546RB-I00.
• Tackling the threat to human health posed by antifungal treatment failure. IP: Jorge Amich Elías. Organismo financiador: Comunidad de Madrid. Atracción de Talento Modalidad 1. Duración: 2022-2026. Nº de Expediente: 2020-T1/BMD-20011
• Relación ambiente-micobioma en pacientes con asma grave. Implicación en el desarrollo de enfermedad y estudio de posibles medidas de prevención hacia la medicina personalizada. IP: Ana Alastruey Izquierdo. Organismo financiador: Fondo de Investigación Sanitaria. Financiación: 32.000 €. Duración: 2021-2023.Nº de Expediente: PI20CIII/00043 MPY317/20
• Atención y tratamiento de enfermedades fúngicas en América Latina. IP: Ana Alastruey Izquierdo Organismo financiador: Global Action for Fungal Infections Dotación: 86.000 €. Duración: 2021- 2023.
• Estudio de biomarcadores involucrados en el desarrollo y evolución de un biofilm fungico. IP: Alicia Gomez López. Organismo financiador: AESi 2021. Financiación: 40.450 €. Duración: 2022-2024. Nº de Expediente: PI21CIII/00012, MPY 435/21
• Mejora del diagnóstico molecular de la Infección Fúngica Invasora: evaluación de la utilidad de nuevas tecnologías y de los estudios inter-comparativos para superar sus limitaciones. IP: Maria Jose Buitrago Serna. Organismo financiador: AESi 2021. Financiación: 49.940 €. Duración: 2022-2024. Nº de Expediente: PI21CIII/00007.
• Infecciones fúngicas invasoras en pacientes neutrónicos, desarrollo de nuevos métodos de diagnóstico molecular, nuevas oportunidades para su tratamiento. IP: Laura Alcazar Fuoli Organismo financiador: AESi 2020. Financiación: 52.000 €. Duración: 2021-2023.
• Persistencia a antifúngicos azólicos en Aspergillus fumigatus: mecanismos, relevancia y diagnóstico. AESI 2022 (PI22CIII/00053). IP: Jorge Amich. Duración: 2023-2025. Financiación 55.000 €
• Modulación diferencial de la persulfidación en el hongo y el hospedador como nueva estrategia antifúngica. Agencia Estatal de Investigación. ID2022-136343OA-I00. IP: Jorge Amich. Duración: 2024-2026. Financiación 118.750 €
• Bridging the gap between environment and patient JPIAMR (AC23CIII_2/00002 (JPIAMR2023-DISTOMOS-103). IP: Jorge Amich. Duración: 2024-2026. Financiación 178.000 €

• Irene García-Barbazán, Alba Torres-Cano, Rocío García-Rodas, Martin Sachse, Daniel Luque, Diego Megías, Oscar Zaragoza. Accumulation of endogenous free radicals is required to induce titan-like cell formation in Cryptococcus neoformans. 2024. mBio. Jan 16;15(1):e0254923. doi: 10.1128/mbio.02549-23.
• Suélen Andreia Rossi, Irene García-Barbazán, Irene Chamorro-Herrero, Carlos Pelleschi Taborda, Óscar Zaragoza, Alberto Zambrano. Use of 2D minilungs from human embryonic stem cells to study the interaction of Cryptococcus neoformans with the respiratory tract. 2023. Microbes and Infection. Nov 18:105262. Online ahead of print. doi: 10.1016/j.micinf.2023.105260.
• Scott J and Amich J*. The role of methionine synthases in fungal metabolism and virulence. Essays Biochem (2023) 67 (5): 853–863.  doi: 10.1042/EBC20230007. IF (2022): 6.4 Q1 Biochemistry and Molecular Biology.
• Peláez-García de la Rasilla T, Mato-López A, Pablos-Puertas, CE, González-Huerta AJ, Gómez-López A, Mellado E and Amich J*. Potential Implication of Azole Persistence in the Treatment Failure of Two Haematological Patients Infected with Aspergillus fumigatus. J. Fungi. 2023, 9, 805. doi. 10.3390/jof9080805. IF (2022): 4.7 Q2 Microbiology
• Lucio J, Gonzalez-Jimenez I, Garcia-Rubio R, Cuetara MS, Mellado E. An expanded agar-based screening method for azole-resistant Aspergillus fumigatus. Mycoses. 2022 Feb;65(2):178-185. doi: 10.1111/myc.13400. IF: 4.9.  Mycology 8/33 (Q2); Dermatology 10/40 (Q1)
• Fisher MC, Alastruey-Izquierdo A, Berman J, Bicanic T, Bignell EM, Bowyer P, Bromley M, Brüggemann R, Garber G, Cornely OA, Gurr SJ, Harrison TS, Kuijper E, Rhodes J, Sheppard DC, Warris A, White PL, Xu J, Zwaan B, Verweij PE. Tackling the emerging threat of antifungal resistance to human health. Nat Rev Microbiol. 2022 Mar 29:1–15. doi: 10.1038/s41579-022-00720-1. IF: 78.297 Microbiology 2/136 (D1/Q1)
• Gomez-Lopez A, Rueda C, Pando Pozo R, Sanchez Gonzalez LM. Dynamics of gliotoxin and bis(methylthio)gliotoxin production during the course of Aspergillus fumigatus infection 2022 Apr 27;60(4):myac025. doi.org/10.1093/mmy/myac025 F.I:  4.076 (Q2)
• Garcia-Rubio R, Gonzalez-Jimenez I, Lucio J, Mellado E. Characterization of Aspergillus fumigatus cross-resistance between clinical and DMI azole drugs. Appl Environ Microbiol. 2021 Mar 1;87(5):e02539-20. doi: 10.1128/AEM.02539-20. IF:4.7 Biotechnology and Applied Microbiology 37/166 (Q1)
• Bernal-Martínez L, S M Gonçalves, B de Andres, C Cunha, I Gonzalez Jimenez, K Lagrou, E Mellado, M L Gaspar, J A Maertens, A Carvalho, L Alcazar-Fuoli.  TREM1 regulates antifungal immune responses in invasive pulmonary aspergillosis. Virulence. 2021 Dec;12(1):570-583.  doi: 10.1080/21505594.2021.1879471.  IF: 6.849 (Q1)
• Sueiro-Olivares M, Scott J, Gago S, Petrovic, Kouroussis E, Zivanovic J, Yu Y, Strobel M, Cunha C, Thomson D, Fortune-Grant R, Thusek S, Bowyer P, Beilhack A, Carvalho A, Bignell E, Filipovic MR and Amich J. Fungal and host protein persulfidation are functionally correlated and modulate both virulence and antifungal response. PLos Biology. 2021. 19 (6), e3001247. doi: 10.1371/journal.pbio.3001247 IF: 9.59 D1 Biology

Las infecciones fúngicas en humanos están causadas por un gran número de especies y comprenden un amplio espectro de enfermedades, afectando cualquier parte del cuerpo. Las más graves son las enfermedades invasoras las cuales tuvieron un importante aumento en su incidencia en los últimos 20-30 años debido a,  i) la epidemia global de SIDA y .ii) los avances médicos (tratamientos con inmunosupresores, terapias con corticoides, trasplantes etc..) que han propiciado el incremento de individuos inmunodeprimidos y la aparición de infecciones fúngicas oportunistas. Así, 13 millones de personas en el mundo están en riesgo de padecer una infección fúngica mortal y 2 millones fallecen anualmente por una de estas infecciones, colocando a las infecciones fúngicas como la quinta causa de muerte a nivel global.

El Laboratorio de Referencia e Investigación en Micología del Instituto de Salud Carlos III realiza una importante actividad investigadora con seis líneas dedicadas al estudio de las infecciones fúngicas invasoras, con el objetivo común de profundizar en el conocimiento de estas infecciones y mejorar el pronóstico de los enfermos. Además, es laboratorio de referencia en Micología para el Sistema Nacional de Salud (SNS) realizando la identificación de levaduras y hongos filamentosos, así como determinación de susceptibilidad a distintos antifúngicos, determinación de concentraciones de antifúngicos en líquidos orgánicos, etc... para todos los hospitales del Sistema Nacional de Salud que lo requieran. Por último el laboratorio alberga la spin off  "Micología molecular SL".

En concreto el Laboratorio ofrece una serie de técnicas al SNS que incluyen, el diagnóstico molecular de infecciones fúngicas en muestras clínicas de pacientes (PCR en tiempo real), detección de anticuerpos, identificación y sensibilidad de hongos filamentosos y levaduras así como la cuantificación de niveles de antifúngicos en plasma y suero. Existe también un programa de vigilancia de detección de cepas resistentes a antifúngicos y se realizan estudios de brotes hospitalarios causados por hongos patógenos. Todas estas técnicas están incluidas dentro de un programa de Calidad y acreditadas por la ENAC.

El laboratorio de Micología tiene a su disposición una amplia variedad de equipos para llevar a cabo su trabajo. Entre ellos se incluyen los siguientes: cabinas de esterilidad, de químicos y de Bioseguridad; PCRs convencionales y PCRs en tiempo real; dos equipos de HPLC; lupas, microscopios ópticos convencionales y de fluorescencia; Equipos de cuantificación de ADN y ARN (Nanodrop y QuantiFluor), espectrofotómetros, contador de células TC20, equipos de electroforesis de ADN, ARN y proteínas y gran variedad de equipamiento de mesa (centrífugas, vórtex, incubadores, agitadores, etc). Además, cuenta con los equipos comunes de la institución como equipos de secuenciación masiva, equipos MALDI-TOF, etc.